Buck Institute: Avançando a pesquisa sobre Parkinson com IA​

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O cliente

​O Instituto Buck para Pesquisa sobre Envelhecimento é um líder global dedicado ao prolongamento da vida humana saudável e ao avanço da pesquisa sobre doenças relacionadas à idade, como Alzheimer e Parkinson.

Com o objetivo de acelerar descobertas, o instituto realizou parceria com a Compass UOL e a AWS para modernizar a abordagem de pesquisa orientada por dados, criando uma prova de conceito com Amazon SageMaker Canvas — um ambiente de machine learning no-code que permite que cientistas construam modelos e gerem insights, mesmo sem conhecimento em programação.

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O desafio

A análise de dados complexos do Fox Insight — incluindo metadados de participantes e dados de microbioma — demandava habilidades técnicas que grande parte dos pesquisadores não possuía. Com isso, a velocidade para testar hipóteses e gerar insights era limitada.

 

A equipe de pesquisa do Buck Institute sobre Parkinson buscava revelar correlações entre hábitos de atividade física e a composição do microbioma intestinal, mas a preparação e a análise manual dos dados dificultavam escalar experimentos, visualizar padrões e validar descobertas com eficiência.

 

O objetivo: criar uma plataforma acessível e unificada para que pesquisadores pudessem explorar dados do Fox Insight, construir modelos preditivos e acelerar a validação de hipóteses — sem nenhuma linha de código.

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A solução

A Compass UOL criou e implementou um ambiente completo, de ponta a ponta, de IA e analytics na AWS, viabilizando fluxos de pesquisa seguros, escaláveis e colaborativos com:

 

- Amazon SageMaker Canvas
- Amazon SageMaker Studio
- Amazon S3
- AWS Glue
- Amazon Athena

Destaques da solução

 

Ambiente de dados unificado: Integração de dados do Fox Insight com dados de microbioma, utilizando o FoxDen como plataforma de exploração, com pipelines de ingestão e pré-processamento simplificados.

 

Modelagem no-code: Construção de modelos de classificação multilabel pelos pesquisadores no Amazon SageMaker Canvas para prever os níveis de atividade física entre participantes de estudos sobre Parkinson.

 

Explicabilidade com SHAP: Identificação de espécies microbianas essenciais associadas a níveis variados de intensidade de atividade física por meio dos recursos de interpretabilidade de modelos.

 

Colaboração e acessibilidade: Análise e colaboração contínua, com conjuntos de dados selecionados e resultados de modelos armazenados no Amazon S3 e consultados no Amazon Athena.

 

Capacitação e treinamento:Treinamento prático para capacitar os pesquisadores do Buck Institute a construir, interpretar e iterar modelos de machine learning de forma independente.

 

Essa base também sustenta etapas futuras, incluindo a expansão de fluxos no Amazon SageMaker Studio e o desenvolvimento planejado de um assistente de pesquisa, impulsionado por IA generativa com Amazon Bedrock e Amazon Q.

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Principais resultados​

Sucesso operacional

Implantação de um ambiente Amazon SageMaker pronto para produção e integrado aos workflows de pesquisa existentes.

Insight científico

Descobertas iniciais sugerindo que atividades físicas podem reduzir bactérias nocivas e aumentar populações microbianas benéficas em pacientes com Parkinson.

Modelagem preditiva

Análise de mais de 200 recursos, validando hipóteses existentes e revelando novas correlações.

Aceleração da pesquisa

Contribuição para uma nova proposta de financiamento junto aos National Institutes of Health (NIH) e para futuras iniciativas de medicina personalizada por meio de insights gerados na plataforma.

Empoderamento do pesquisador

Condução de análises avançadas de machine learning de forma autônoma por cientistas não técnicos.

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Nosso impacto

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